根據行政院通過交通及建設部組織法草案說明，未來民航局將目前17個航空站管轄機場業務改設為9個航空站，包括由民航局直接督導之高雄與台北國際航空站及花蓮、馬公、台南、台東、金門、台中與嘉義航空站等9個航空站，以及由台北國際航空站督導之北竿與南竿航空輔助站、高雄國際航空站督導之屏東與恆春航空輔助站、馬公航空站督導之望安與七美航空輔助站、台東航空站督導之綠島與蘭嶼航空輔助站。
綜觀各航空站均以縣為單位直屬民航局督導，惟連江縣的南、北竿機場由台北國際航空站督導，就意義上來說頗有寄人籬下意味，因此曹委員力爭南北竿機場應設馬祖航空站由民航局直接督導，提案要求交通部應比照台南、嘉義設置直屬航空站，擴大編制並充實人力、職能，以符馬祖未來發展。
在曹爾忠力挽狂瀾全力爭取下，與會委員均支持曹委員的提案，通過增設馬祖航空站為第10個直屬民航局航空站，最後交通部毛治國部長允諾行政院組織再造將依曹爾忠委員提案辦理。
曹委員表示，南北竿機場的客運量早已超過許多國內機場，以未來發展做為考量應提升位階，將來南北竿機場不需透過台北航空站，可直接向民航局反應需求互作溝通，是馬祖航空發展的一個里程碑。
曹爾忠於審查協商時面對交通部毛治國部長力爭成立馬祖航空站
這麼幹就對了，為我們家鄉贏得最大發展空間，讓馬祖走出去、機場再升級，贏回馬祖人的尊嚴。